Subversion は、関連の無いプロジェクトは別のリポジトリにした方が良いと判断いたしまして、次のサイトを参考にデータを整理しておりました。

Subversionリポジトリ再構成 – 日々の報告書

ポイントはページ中段にあります、「移動やコピーをした場合、その情報を含めて dump すること」という点にあると思います。差分管理データには「どっからコピーしたのか？」が記録されており、これを含めないと load する際にエラーになります（実際になりました）。

整理ついでに Node-path を変更したかったので sed コマンドが大活躍でした。こういう、データが大きくてエディタで開きたくないんだけど、変更する箇所が単純な変換作業にはうってつけのコマンドかと思います。

sed の詳細はこちらがおすすめです。本当の意味で必携の愛読書でして、いつも鞄に入ってます。